Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms