Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vamp1Q62442 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vamp1Q62442 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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