Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpd52Q62393 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms