Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms