Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SnrpaQ62189 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpaQ62189 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms