Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RhocQ62159 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms