Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga7Q61738 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga7Q61738 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms