Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms