Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms