Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms