Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcolceQ61398 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms