Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcf12Q61286 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf12Q61286 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms