Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clns1aQ61189 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clns1aQ61189 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clns1aQ61189 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms