Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lama5Q61001 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lama5Q61001 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lama5Q61001 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lama5Q61001 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lama5Q61001 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lama5Q61001 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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