Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf3Q60980 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms