Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cnot7Q60809 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cnot7Q60809 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot7Q60809 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms