Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf4Q60793 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms