Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb6Q60692 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms