Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ItgaeQ60677 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms