Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2aQ60648 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2aQ60648 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms