Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3aQ60520 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms