Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Utp20Q5XG71 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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