Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabl6Q5U3K5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms