Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc42Q5SV66 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42Q5SV66 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms