Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh12Q5RJH3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms