Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm11487Q5RIS0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms