Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Trappc1Q5NCF2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Trappc1Q5NCF2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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