Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SynaQ5G5D5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms