Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms