Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms