Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chsy3Q5DTK1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chsy3Q5DTK1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms