Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms