Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms