Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xirp2Q4U4S6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms