Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox3aQ4TU90 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox3aQ4TU90 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms