Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3lQ4KL14 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms