Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snhg11Q4G0K9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms