Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms