Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms