Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim26Q3V460 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim26Q3V460 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms