Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms