Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap65Q3V0B4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap65Q3V0B4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms