Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms