Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms