Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Prdm6Q3UZD5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm6Q3UZD5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm6Q3UZD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm6Q3UZD5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm6Q3UZD5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm6Q3UZD5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm6Q3UZD5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm6Q3UZD5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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