Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chpf2Q3UU43 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms