Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
A530084C06RikQ3UTW2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms