Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms