Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B230104I21RikQ3USW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B230104I21RikQ3USW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms