Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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